收到扣押薪资命令书是不合法的，因为《劳动法》规定工资应按月支付给劳动者，不得克扣或无故拖欠。若用人单位这样做，劳动者有权解除劳动合同并要求赔偿。不及时处理可能导致劳动者权益受损，无法及时获得应得工资。
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对扣押薪资，常见处理方式是先与用人单位协商，要求支付。协商无果时，可申请劳动仲裁或提起诉讼。《劳动法》支持劳动者维护自身权益，应根据实际情况选择合适方式。
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扣押薪资应这样处理：1. 与用人单位沟通，明确薪资被扣原因，要求立即支付。2. 若沟通无果，收集证据，如工资条、劳动合同等，向劳动仲裁委员会申请仲裁。3. 仲裁不满，可向法院提起诉讼，依据《劳动法》维权，要求支付薪资及赔偿。